清除摩尔庄园中的树木需要装备斧头，再靠近树枝进行交互，不能使用镰刀、铁镐或铁锹代替。进入家园后，先点击右下角箭头展开工具栏，在农具列表中选择斧头；如果是前期刚进入游戏，需要先完成新手流程并解锁斧头，未解锁时即使站到树旁也无法进行砍伐。斧头选中后，操控角色靠近目标树木，等待树枝被黄色方框标记，再点击角色右侧出现的斧头按钮即可完成一次清理操作。
家园清理应按照“展开工具栏—装备斧头—靠近树木—锁定黄色方框—点击斧头”的顺序操作。树木距离过远时，快捷按钮不会正常出现，需要先移动到树枝附近；视角被房屋、围栏或装饰物挡住时，可先调整镜头，再确认黄色选框是否落在树枝上。不要只点击树干中央或空地，系统识别的有效目标通常是被标记出来的枝干位置。一次操作没有清除时，重新调整站位并再次点击斧头即可，重点是让角色处于交互距离内，而不是反复更换其他农具。
新手阶段优先清理家园中挡住农田的位置，等斧头解锁并熟悉操作后，再前往伐木林收集更多木材。家园和伐木林都属于可以进行伐木的区域，但伐木林通常更适合集中处理树木和补充材料；农夫等级提升后，游戏会开放伐木林，玩家可以在那里获取木材并用于制作或升级工具。如果目标是开垦土地，先清掉影响地块的树木，再根据障碍物类型分别处理：树木用斧头，杂草用镰刀，石块用铁镐，避免拿错工具导致没有反应。
无法清除树木时，优先检查三个条件：斧头是否已经解锁、当前装备是否确实为斧头、角色是否靠近了被黄色方框标记的枝干。若工具栏中没有斧头，先推进家园新手任务；若斧头图标已经显示但按钮不响应，移动一小段距离并重新选中目标，通常即可恢复交互。完成大面积清理后，可保留不影响耕地和建筑摆放的树木，避免为了整齐全部砍掉；需要快速整理家园时，先清理农田边缘和建筑预留区域，再处理外围树木，能减少来回移动并更快腾出可用空间。
